Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRMT12Q53H54 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT12Q53H54 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms