Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCE1P61221 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms