Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	ERV29	YGR284C	933 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	CDA2	YLR308W	939 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	APL4	YPR029C	2499 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	OAF3	YKR064W	2592 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	PEX21	YGR239C	867 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	COX2	Q0250	756 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	BET1	YIL004C	429 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MRPL16	YBL038W	699 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	ERG2	YMR202W	669 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YOR186W	YOR186W	435 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YVC1	YOR087W	2028 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	ARP4	YJL081C	1470 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	NTO1	YPR031W	2247 nt		3.27	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	ACK1	YDL203C	1872 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YHR202W	YHR202W	1809 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SUP45	YBR143C	1314 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	FMP10	YER182W	735 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	TOS8	YGL096W	831 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YGL101W	YGL101W	648 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YGR107W	YGR107W	450 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YJL175W	YJL175W	513 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MBB1	YJL199C	327 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YUH1	YJR099W	711 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YBL081W	YBL081W	1107 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	RRP36	YOR287C	903 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	PRP22	YER013W	3438 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	DBP10	YDL031W	2988 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	NOP4	YPL043W	2058 nt		3.26	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	PGS1	YCL004W	1566 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	HMS1	YOR032C	1305 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MRPS35	YGR165W	1038 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YLR012C	YLR012C	300 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	IST1	YNL265C	897 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	DIB1	YPR082C	432 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	PBS2	YJL128C	2007 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YFL040W	YFL040W	1623 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	CTK1	YKL139W	1587 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.25	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YCR007C	YCR007C	720 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	PRP11	YDL043C	801 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SPO16	YHR153C	597 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MAK16	YAL025C	921 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	CDC73	YLR418C	1182 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SSO2	YMR183C	888 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	UBP12	YJL197W	3765 nt		3.24	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MEF1	YLR069C	2286 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	DSL1	YNL258C	2265 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MSS2	YDL107W	1056 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	RPC11	YDR045C	333 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SCL1	YGL011C	759 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MTR2	YKL186C	555 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	TAF4	YMR005W	1167 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	HRT1	YOL133W	366 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YOR296W	YOR296W	3870 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SMI1	YGR229C	1518 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	TFB2	YPL122C	1542 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	STU1	YBL034C	4542 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.23	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	ABD1	YBR236C	1311 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	MCM21	YDR318W	1107 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	APA2	YDR530C	978 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	HAT2	YEL056W	1206 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	YGR219W	YGR219W	342 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	TMA16	YOR252W	537 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SIN3	YOL004W	4611 nt		3.22	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.21	□□□□□ -1.89
ATG12	P38316	SER3	YER081W	1410 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	SLI1	YGR212W	1407 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MED2	YDL005C	1296 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	PAN5	YHR063C	1140 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	COA4	YLR218C	453 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	SPC24	YMR117C	642 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	TMC1	YOR052C	453 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	TAF14	YPL129W	735 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	ERB1	YMR049C	2424 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MET10	YFR030W	3108 nt		3.21	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MSA1	YOR066W	1890 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MIG3	YER028C	1185 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	NSA2	YER126C	786 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	RPL15A	YLR029C	615 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	SPS4	YOR313C	1017 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	SLM5	YCR024C	1479 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.2	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	EPO1	YMR124W	2832 nt		3.2	□□□□□ -1.9

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