Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH5P33151 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH5P33151 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH5P33151 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH5P33151 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH5P33151 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH5P33151 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH5P33151 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH5P33151 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms