Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA4P22748 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA4P22748 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA4P22748 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA4P22748 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA4P22748 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA4P22748 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA4P22748 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA4P22748 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA4P22748 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA4P22748 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA4P22748 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA4P22748 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA4P22748 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA4P22748 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.2 ms