Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms