Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms