Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms