Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms