Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIRT1Q96EB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms