Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms