Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TIMM23BQ5SRD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms