Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIGQ13278 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIGQ13278 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIGQ13278 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIGQ13278 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIGQ13278 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIGQ13278 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIGQ13278 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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