Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2P04141 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2P04141 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2P04141 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2P04141 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF2P04141 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF2P04141 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF2P04141 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2P04141 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF2P04141 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF2P04141 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms