Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM4AO75164 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms