Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms