Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO3A2RU48 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms