Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18L2Q9UHA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SS18L2Q9UHA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SS18L2Q9UHA2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18L2Q9UHA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms