Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SERINC1Q9NRX5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERINC1Q9NRX5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERINC1Q9NRX5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERINC1Q9NRX5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERINC1Q9NRX5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms