Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-211ENST00000585363 241 ntTSL 55.24□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 51.9
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EXOSC5Q9NQT4 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 51.8
EXOSC5Q9NQT4 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)20.13■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)19.53■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 51.6
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EXOSC5Q9NQT4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-203ENST00000585514 564 ntTSL 317.09■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 516.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 216.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-210ENST00000592140 533 ntTSL 516.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 216■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-210ENST00000455762 1022 ntTSL 515.08■□□□□ 01e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-207ENST00000590366 538 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-218ENST00000482686 614 ntTSL 314.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-220ENST00000486681 966 ntTSL 314.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 214.32□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-205ENST00000461465 480 ntTSL 413.86□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-208ENST00000591064 837 ntTSL 313.39□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-206ENST00000590088 3131 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 412.59□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 412.5□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-207ENST00000431323 888 ntTSL 512.14□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-206ENST00000421397 574 ntTSL 511.63□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-208ENST00000443203 553 ntTSL 411.61□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 410.59□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 NELFA-204ENST00000411649 561 ntTSL 410.42□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-211ENST00000470986 706 ntTSL 210.39□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF180-209ENST00000592095 3270 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 51.6
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EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-209ENST00000470511 567 ntTSL 48.65□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKCZ-217ENST00000481140 713 ntTSL 46.26□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 56.06□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-207ENST00000510681 536 ntTSL 43.85□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 EDA-211ENST00000530321 339 ntTSL 22.94□□□□□ -1.941e-7■■■■■ 51.6
EXOSC5Q9NQT4 AMPD3-215ENST00000532250 576 ntTSL 47.48□□□□□ -1.211e-13■■■■■ 51.1
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EXOSC5Q9NQT4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 51
EXOSC5Q9NQT4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 51
EXOSC5Q9NQT4 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 51
EXOSC5Q9NQT4 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 51
EXOSC5Q9NQT4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-9■■■■■ 50.9
EXOSC5Q9NQT4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 50.9
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EXOSC5Q9NQT4 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 50.8
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EXOSC5Q9NQT4 USP10-214ENST00000567526 330 ntTSL 35.18□□□□□ -1.585e-8■■■■■ 50.7
EXOSC5Q9NQT4 CENPC-207ENST00000515140 933 ntTSL 1 (best)3.15□□□□□ -1.918e-8■■■■■ 50.4
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EXOSC5Q9NQT4 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 50.1
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EXOSC5Q9NQT4 SRPK1-208ENST00000507292 634 ntTSL 32.41□□□□□ -2.021e-7■■■■■ 50.1
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EXOSC5Q9NQT4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.027e-8■■■■■ 49.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 320.16■□□□□ 0.827e-8■■■■■ 49.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.637e-8■■■■■ 49.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 49.6
EXOSC5Q9NQT4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 49.6
EXOSC5Q9NQT4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.579e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 PEG3-203ENST00000594389 411 ntTSL 317.78■□□□□ 0.449e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.439e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.399e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.019e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 PEG3-204ENST00000594706 583 ntTSL 314.68□□□□□ -0.069e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.169e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.679e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.089e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 PEG3-205ENST00000596261 570 ntTSL 47.29□□□□□ -1.249e-9■■■■■ 49.4
EXOSC5Q9NQT4 ATF7IP2-205ENST00000535850 1907 ntTSL 28.41□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 49.1
EXOSC5Q9NQT4 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 49.1
EXOSC5Q9NQT4 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 49.1
EXOSC5Q9NQT4 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 49.1
EXOSC5Q9NQT4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.387e-11■■■■■ 48.6
EXOSC5Q9NQT4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.477e-11■■■■■ 48.6
EXOSC5Q9NQT4 FAAP100-203ENST00000443656 3822 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.547e-11■■■■■ 48.6
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