RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591064.1

ZNF180-208, Transcript of zinc finger protein 180, human

TSL 3

Gene ZNF180, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF180-208	ENST00000591064	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.64	■■■■■ 4.1
ZNF180-208	ENST00000591064	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.19	■■■■□ 3.38
ZNF180-208	ENST00000591064	ABCC9	O60706	1549 aa		35.32	■■■■□ 3.25
ZNF180-208	ENST00000591064	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ZNF180-208	ENST00000591064	NACAD	O15069	1562 aa		34.01	■■■■□ 3.03
ZNF180-208	ENST00000591064	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.91	■■■■□ 3.02
ZNF180-208	ENST00000591064	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
ZNF180-208	ENST00000591064	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.82	■■■■□ 3
ZNF180-208	ENST00000591064	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.66	■■■□□ 2.98
ZNF180-208	ENST00000591064	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ZNF180-208	ENST00000591064	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.98	■■■□□ 2.87
ZNF180-208	ENST00000591064	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ZNF180-208	ENST00000591064	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.95	■■■□□ 2.86
ZNF180-208	ENST00000591064	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ZNF180-208	ENST00000591064	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ZNF180-208	ENST00000591064	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ZNF180-208	ENST00000591064	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ZNF180-208	ENST00000591064	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.76	■■■□□ 2.67
ZNF180-208	ENST00000591064	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ZNF180-208	ENST00000591064	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
ZNF180-208	ENST00000591064	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ZNF180-208	ENST00000591064	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ZNF180-208	ENST00000591064	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ZNF180-208	ENST00000591064	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ZNF180-208	ENST00000591064	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ZNF180-208	ENST00000591064	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ZNF180-208	ENST00000591064	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
ZNF180-208	ENST00000591064	WIZ	O95785	1651 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ZNF180-208	ENST00000591064	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
ZNF180-208	ENST00000591064	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.66	■■■□□ 2.5
ZNF180-208	ENST00000591064	NES	P48681	1621 aa		30.56	■■■□□ 2.48
ZNF180-208	ENST00000591064	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.55	■■■□□ 2.48
ZNF180-208	ENST00000591064	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.46	■■■□□ 2.47
ZNF180-208	ENST00000591064	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.43	■■■□□ 2.46
ZNF180-208	ENST00000591064	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.33	■■■□□ 2.45
ZNF180-208	ENST00000591064	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.28	■■■□□ 2.44
ZNF180-208	ENST00000591064	CFTR	P13569	1480 aa		30.25	■■■□□ 2.43
ZNF180-208	ENST00000591064	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.25	■■■□□ 2.43
ZNF180-208	ENST00000591064	CUX2	O14529	1486 aa		30.18	■■■□□ 2.42
ZNF180-208	ENST00000591064	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
ZNF180-208	ENST00000591064	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.12	■■■□□ 2.41
ZNF180-208	ENST00000591064	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.1	■■■□□ 2.41
ZNF180-208	ENST00000591064	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.07	■■■□□ 2.4
ZNF180-208	ENST00000591064	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.06	■■■□□ 2.4
ZNF180-208	ENST00000591064	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30	■■■□□ 2.39
ZNF180-208	ENST00000591064	WDR62	O43379	1518 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ZNF180-208	ENST00000591064	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.36
ZNF180-208	ENST00000591064	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ZNF180-208	ENST00000591064	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ZNF180-208	ENST00000591064	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ZNF180-208	ENST00000591064	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ZNF180-208	ENST00000591064	CUX1	P39880	1505 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ZNF180-208	ENST00000591064	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
ZNF180-208	ENST00000591064	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
ZNF180-208	ENST00000591064	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.27	■■■□□ 2.28
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
ZNF180-208	ENST00000591064	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ZNF180-208	ENST00000591064	SOGA1	O94964	1423 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ZNF180-208	ENST00000591064	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.19	■■■□□ 2.26
ZNF180-208	ENST00000591064	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.19	■■■□□ 2.26
ZNF180-208	ENST00000591064	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
ZNF180-208	ENST00000591064	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.15	■■■□□ 2.26
ZNF180-208	ENST00000591064	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.14	■■■□□ 2.26
ZNF180-208	ENST00000591064	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.11	■■■□□ 2.25
ZNF180-208	ENST00000591064	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ZNF180-208	ENST00000591064	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.1	■■■□□ 2.25
ZNF180-208	ENST00000591064	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
ZNF180-208	ENST00000591064	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29	■■■□□ 2.23
ZNF180-208	ENST00000591064	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ZNF180-208	ENST00000591064	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ZNF180-208	ENST00000591064	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ZNF180-208	ENST00000591064	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ZNF180-208	ENST00000591064	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ZNF180-208	ENST00000591064	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
ZNF180-208	ENST00000591064	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ZNF180-208	ENST00000591064	CHD1	O14646	1710 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ZNF180-208	ENST00000591064	FBLN2	P98095	1184 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ZNF180-208	ENST00000591064	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ZNF180-208	ENST00000591064	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
ZNF180-208	ENST00000591064	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ZNF180-208	ENST00000591064	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ZNF180-208	ENST00000591064	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ZNF180-208	ENST00000591064	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.57	■■■□□ 2.16
ZNF180-208	ENST00000591064	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.52	■■■□□ 2.16
ZNF180-208	ENST00000591064	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.49	■■■□□ 2.15
ZNF180-208	ENST00000591064	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.49	■■■□□ 2.15
ZNF180-208	ENST00000591064	IGF1R	P08069	1367 aa		28.45	■■■□□ 2.14
ZNF180-208	ENST00000591064	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ZNF180-208	ENST00000591064	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ZNF180-208	ENST00000591064	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ZNF180-208	ENST00000591064	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.43	■■■□□ 2.14
ZNF180-208	ENST00000591064	CUL7	Q14999	1698 aa		28.43	■■■□□ 2.14
ZNF180-208	ENST00000591064	NUP160	Q12769	1436 aa		28.39	■■■□□ 2.14
ZNF180-208	ENST00000591064	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.37	■■■□□ 2.13
ZNF180-208	ENST00000591064	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ZNF180-208	ENST00000591064	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ZNF180-208	ENST00000591064	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ZNF180-208	ENST00000591064	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ZNF180-208	ENST00000591064	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ZNF180-208	ENST00000591064	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.14	■■■□□ 2.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms