RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470596.5

PRKCZ-210, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-210ENST00000470596 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.7■■■■■ 5.87
PRKCZ-210ENST00000470596 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.11■■■■■ 4.97
PRKCZ-210ENST00000470596 ABCC9O60706 1549 aa45.73■■■■■ 4.91
PRKCZ-210ENST00000470596 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.58■■■■■ 4.57
PRKCZ-210ENST00000470596 NACADO15069 1562 aa43.46■■■■■ 4.55
PRKCZ-210ENST00000470596 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.3■■■■■ 4.52
PRKCZ-210ENST00000470596 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.16■■■■■ 4.5
PRKCZ-210ENST00000470596 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
PRKCZ-210ENST00000470596 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.82■■■■■ 4.45
PRKCZ-210ENST00000470596 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.79■■■■■ 4.44
PRKCZ-210ENST00000470596 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.7■■■■■ 4.43
PRKCZ-210ENST00000470596 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.58■■■■■ 4.41
PRKCZ-210ENST00000470596 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.38■■■■■ 4.37
PRKCZ-210ENST00000470596 SCRIBQ14160 1630 aa41.95■■■■■ 4.31
PRKCZ-210ENST00000470596 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.86■■■■■ 4.29
PRKCZ-210ENST00000470596 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.34■■■■■ 4.21
PRKCZ-210ENST00000470596 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
PRKCZ-210ENST00000470596 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.17■■■■■ 4.18
PRKCZ-210ENST00000470596 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
PRKCZ-210ENST00000470596 SMARCA4P51532 1647 aa40.16■■■■■ 4.02
PRKCZ-210ENST00000470596 NCAPD3P42695 1498 aa40.13■■■■■ 4.01
PRKCZ-210ENST00000470596 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
PRKCZ-210ENST00000470596 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.06■■■■■ 4
PRKCZ-210ENST00000470596 SMARCA2P51531 1590 aa40.01■■■■■ 4
PRKCZ-210ENST00000470596 HMGXB3Q12766 1538 aa39.86■■■■□ 3.97
PRKCZ-210ENST00000470596 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.83■■■■□ 3.97
PRKCZ-210ENST00000470596 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.8■■■■□ 3.96
PRKCZ-210ENST00000470596 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
PRKCZ-210ENST00000470596 ERCC6Q03468 1493 aa39.43■■■■□ 3.9
PRKCZ-210ENST00000470596 NESP48681 1621 aa39.36■■■■□ 3.89
PRKCZ-210ENST00000470596 WIZO95785 1651 aa39.33■■■■□ 3.89
PRKCZ-210ENST00000470596 CUX2O14529 1486 aa39.32■■■■□ 3.89
PRKCZ-210ENST00000470596 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
PRKCZ-210ENST00000470596 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.11■■■■□ 3.85
PRKCZ-210ENST00000470596 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.09■■■■□ 3.85
PRKCZ-210ENST00000470596 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
PRKCZ-210ENST00000470596 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
PRKCZ-210ENST00000470596 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.93■■■■□ 3.82
PRKCZ-210ENST00000470596 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.88■■■■□ 3.81
PRKCZ-210ENST00000470596 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.86■■■■□ 3.81
PRKCZ-210ENST00000470596 CFTRP13569 1480 aa38.62■■■■□ 3.77
PRKCZ-210ENST00000470596 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.49■■■■□ 3.75
PRKCZ-210ENST00000470596 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.49■■■■□ 3.75
PRKCZ-210ENST00000470596 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.43■■■■□ 3.74
PRKCZ-210ENST00000470596 WDR62O43379 1518 aa38.43■■■■□ 3.74
PRKCZ-210ENST00000470596 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.42■■■■□ 3.74
PRKCZ-210ENST00000470596 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.42■■■■□ 3.74
PRKCZ-210ENST00000470596 PRDM2Q13029 1718 aa38.24■■■■□ 3.71
PRKCZ-210ENST00000470596 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
PRKCZ-210ENST00000470596 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
PRKCZ-210ENST00000470596 ABCC8Q09428 1581 aa37.85■■■■□ 3.65
PRKCZ-210ENST00000470596 TOPBP1Q92547 1522 aa37.78■■■■□ 3.64
PRKCZ-210ENST00000470596 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.72■■■■□ 3.63
PRKCZ-210ENST00000470596 IFT140Q96RY7 1462 aa37.65■■■■□ 3.62
PRKCZ-210ENST00000470596 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
PRKCZ-210ENST00000470596 OSCARQ8IYS5 282 aa37.5■■■■□ 3.59
PRKCZ-210ENST00000470596 TRIM41Q8WV44 630 aa37.45■■■■□ 3.59
PRKCZ-210ENST00000470596 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
PRKCZ-210ENST00000470596 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
PRKCZ-210ENST00000470596 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
PRKCZ-210ENST00000470596 CUX1P39880 1505 aa37.36■■■■□ 3.57
PRKCZ-210ENST00000470596 SOGA1O94964 1423 aa37.31■■■■□ 3.56
PRKCZ-210ENST00000470596 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.29■■■■□ 3.56
PRKCZ-210ENST00000470596 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.25■■■■□ 3.55
PRKCZ-210ENST00000470596 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.22■■■■□ 3.55
PRKCZ-210ENST00000470596 WDR97A6NE52 1622 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKCZ-210ENST00000470596 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.1■■■■□ 3.53
PRKCZ-210ENST00000470596 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.1■■■■□ 3.53
PRKCZ-210ENST00000470596 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.1■■■■□ 3.53
PRKCZ-210ENST00000470596 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
PRKCZ-210ENST00000470596 CHD1O14646 1710 aa37.07■■■■□ 3.53
PRKCZ-210ENST00000470596 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.52
PRKCZ-210ENST00000470596 ARHGEF11O15085 1522 aa36.99■■■■□ 3.51
PRKCZ-210ENST00000470596 TOP2BQ02880 1626 aa36.98■■■■□ 3.51
PRKCZ-210ENST00000470596 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.97■■■■□ 3.51
PRKCZ-210ENST00000470596 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.95■■■■□ 3.51
PRKCZ-210ENST00000470596 GRIN2BQ13224 1484 aa36.91■■■■□ 3.5
PRKCZ-210ENST00000470596 SYNJ1O43426 1573 aa36.9■■■■□ 3.5
PRKCZ-210ENST00000470596 FBLN2P98095 1184 aa36.88■■■■□ 3.49
PRKCZ-210ENST00000470596 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.87■■■■□ 3.49
PRKCZ-210ENST00000470596 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
PRKCZ-210ENST00000470596 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.85■■■■□ 3.49
PRKCZ-210ENST00000470596 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.8■■■■□ 3.48
PRKCZ-210ENST00000470596 PBRM1Q86U86 1689 aa36.74■■■■□ 3.47
PRKCZ-210ENST00000470596 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
PRKCZ-210ENST00000470596 SYNJ2O15056 1496 aa36.7■■■■□ 3.47
PRKCZ-210ENST00000470596 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.64■■■■□ 3.46
PRKCZ-210ENST00000470596 ARAP1Q96P48 1450 aa36.64■■■■□ 3.46
PRKCZ-210ENST00000470596 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.64■■■■□ 3.46
PRKCZ-210ENST00000470596 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.52■■■■□ 3.44
PRKCZ-210ENST00000470596 ADAMTS12P58397 1594 aa36.45■■■■□ 3.43
PRKCZ-210ENST00000470596 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.44■■■■□ 3.42
PRKCZ-210ENST00000470596 GRIN2AQ12879 1464 aa36.42■■■■□ 3.42
PRKCZ-210ENST00000470596 KIF27Q86VH2 1401 aa36.31■■■■□ 3.4
PRKCZ-210ENST00000470596 NUP160Q12769 1436 aa36.29■■■■□ 3.4
PRKCZ-210ENST00000470596 CEP170Q5SW79 1584 aa36.21■■■■□ 3.39
PRKCZ-210ENST00000470596 IGF1RP08069 1367 aa36.2■■■■□ 3.39
PRKCZ-210ENST00000470596 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
PRKCZ-210ENST00000470596 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.11■■■■□ 3.37
PRKCZ-210ENST00000470596 CUL7Q14999 1698 aa36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms