Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED28Q9H204 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED28Q9H204 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED28Q9H204 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED28Q9H204 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED28Q9H204 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED28Q9H204 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms