Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR60Q8WVS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR60Q8WVS4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR60Q8WVS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR60Q8WVS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR60Q8WVS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR60Q8WVS4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR60Q8WVS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR60Q8WVS4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR60Q8WVS4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR60Q8WVS4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms