Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BRK1Q8WUW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRK1Q8WUW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRK1Q8WUW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRK1Q8WUW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRK1Q8WUW1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms