Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASC2Q6XLA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASC2Q6XLA1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASC2Q6XLA1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASC2Q6XLA1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASC2Q6XLA1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms