Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSBN1Q5VWQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSBN1Q5VWQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSBN1Q5VWQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RSBN1Q5VWQ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSBN1Q5VWQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms