Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRPF38BQ5VTL8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRPF38BQ5VTL8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRPF38BQ5VTL8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRPF38BQ5VTL8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRPF38BQ5VTL8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRPF38BQ5VTL8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRPF38BQ5VTL8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRPF38BQ5VTL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRPF38BQ5VTL8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PRPF38BQ5VTL8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRPF38BQ5VTL8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRPF38BQ5VTL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRPF38BQ5VTL8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRPF38BQ5VTL8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRPF38BQ5VTL8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRPF38BQ5VTL8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRPF38BQ5VTL8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRPF38BQ5VTL8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PRPF38BQ5VTL8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRPF38BQ5VTL8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRPF38BQ5VTL8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRPF38BQ5VTL8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRPF38BQ5VTL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms