Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HABP4Q5JVS0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HABP4Q5JVS0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HABP4Q5JVS0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HABP4Q5JVS0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HABP4Q5JVS0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HABP4Q5JVS0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HABP4Q5JVS0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HABP4Q5JVS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HABP4Q5JVS0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HABP4Q5JVS0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HABP4Q5JVS0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HABP4Q5JVS0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HABP4Q5JVS0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HABP4Q5JVS0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HABP4Q5JVS0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HABP4Q5JVS0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
HABP4Q5JVS0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HABP4Q5JVS0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HABP4Q5JVS0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HABP4Q5JVS0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HABP4Q5JVS0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HABP4Q5JVS0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HABP4Q5JVS0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HABP4Q5JVS0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HABP4Q5JVS0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HABP4Q5JVS0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HABP4Q5JVS0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms