Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
R3HDM1Q15032 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
R3HDM1Q15032 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
R3HDM1Q15032 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
R3HDM1Q15032 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
R3HDM1Q15032 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
R3HDM1Q15032 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
R3HDM1Q15032 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
R3HDM1Q15032 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
R3HDM1Q15032 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
R3HDM1Q15032 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
R3HDM1Q15032 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
R3HDM1Q15032 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
R3HDM1Q15032 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
R3HDM1Q15032 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
R3HDM1Q15032 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
R3HDM1Q15032 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
R3HDM1Q15032 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
R3HDM1Q15032 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
R3HDM1Q15032 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
R3HDM1Q15032 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
R3HDM1Q15032 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
R3HDM1Q15032 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
R3HDM1Q15032 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
R3HDM1Q15032 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
R3HDM1Q15032 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
R3HDM1Q15032 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
R3HDM1Q15032 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
R3HDM1Q15032 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
R3HDM1Q15032 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
R3HDM1Q15032 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
R3HDM1Q15032 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
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