Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRDNQ13061 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRDNQ13061 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRDNQ13061 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRDNQ13061 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRDNQ13061 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRDNQ13061 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRDNQ13061 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRDNQ13061 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRDNQ13061 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRDNQ13061 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRDNQ13061 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRDNQ13061 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRDNQ13061 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRDNQ13061 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
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