Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DEFA3P59666 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEFA3P59666 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEFA3P59666 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEFA3P59666 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DEFA3P59666 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEFA3P59666 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms