Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB2P49721 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMB2P49721 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB2P49721 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB2P49721 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB2P49721 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB2P49721 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms