Protein–RNA interactions for Protein: P47888

OR3A3, Olfactory receptor 3A3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR3A3P47888 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR3A3P47888 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OR3A3P47888 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OR3A3P47888 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OR3A3P47888 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OR3A3P47888 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OR3A3P47888 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OR3A3P47888 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OR3A3P47888 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OR3A3P47888 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OR3A3P47888 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OR3A3P47888 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OR3A3P47888 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OR3A3P47888 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OR3A3P47888 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms