Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VHLP40337 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VHLP40337 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VHLP40337 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VHLP40337 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VHLP40337 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VHLP40337 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VHLP40337 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VHLP40337 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VHLP40337 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VHLP40337 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VHLP40337 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VHLP40337 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VHLP40337 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VHLP40337 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VHLP40337 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VHLP40337 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VHLP40337 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VHLP40337 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VHLP40337 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VHLP40337 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VHLP40337 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VHLP40337 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VHLP40337 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VHLP40337 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VHLP40337 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VHLP40337 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VHLP40337 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VHLP40337 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VHLP40337 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VHLP40337 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VHLP40337 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VHLP40337 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VHLP40337 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VHLP40337 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VHLP40337 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VHLP40337 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VHLP40337 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VHLP40337 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VHLP40337 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VHLP40337 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VHLP40337 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VHLP40337 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VHLP40337 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VHLP40337 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VHLP40337 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VHLP40337 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VHLP40337 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VHLP40337 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VHLP40337 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VHLP40337 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VHLP40337 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VHLP40337 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VHLP40337 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VHLP40337 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VHLP40337 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VHLP40337 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VHLP40337 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VHLP40337 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VHLP40337 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VHLP40337 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VHLP40337 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VHLP40337 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VHLP40337 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VHLP40337 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VHLP40337 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VHLP40337 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VHLP40337 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VHLP40337 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VHLP40337 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VHLP40337 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VHLP40337 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VHLP40337 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VHLP40337 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VHLP40337 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VHLP40337 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VHLP40337 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VHLP40337 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VHLP40337 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VHLP40337 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VHLP40337 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VHLP40337 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VHLP40337 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VHLP40337 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VHLP40337 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VHLP40337 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VHLP40337 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VHLP40337 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VHLP40337 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VHLP40337 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VHLP40337 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VHLP40337 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VHLP40337 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VHLP40337 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VHLP40337 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VHLP40337 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VHLP40337 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VHLP40337 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VHLP40337 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VHLP40337 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms