Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF30P17039 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF30P17039 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF30P17039 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF30P17039 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF30P17039 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF30P17039 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF30P17039 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF30P17039 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF30P17039 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF30P17039 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms