Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFC1P0CG37 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFC1P0CG37 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFC1P0CG37 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFC1P0CG37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFC1P0CG37 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms