Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSPAN13O95857 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPAN13O95857 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN13O95857 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN13O95857 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSPAN13O95857 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms