Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYCBP2O75592 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYCBP2O75592 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYCBP2O75592 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYCBP2O75592 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MYCBP2O75592 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MYCBP2O75592 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYCBP2O75592 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYCBP2O75592 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBP2O75592 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYCBP2O75592 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYCBP2O75592 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYCBP2O75592 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms