Protein–RNA interactions for Protein: A6NEN9

CXorf65, Uncharacterized protein CXorf65, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf65A6NEN9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXorf65A6NEN9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf65A6NEN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXorf65A6NEN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXorf65A6NEN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXorf65A6NEN9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf65A6NEN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms