Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPANXCQ9NY87 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPANXCQ9NY87 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms