Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms