Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC82Q8N4S0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms