Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NF2P35240 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NF2P35240 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NF2P35240 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NF2P35240 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NF2P35240 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NF2P35240 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NF2P35240 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NF2P35240 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NF2P35240 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NF2P35240 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NF2P35240 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NF2P35240 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NF2P35240 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NF2P35240 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NF2P35240 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NF2P35240 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NF2P35240 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms