Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPO95166 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPO95166 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms