Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCP110O43303 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCP110O43303 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCP110O43303 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCP110O43303 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCP110O43303 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCP110O43303 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCP110O43303 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCP110O43303 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCP110O43303 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCP110O43303 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.5 ms