Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms