Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms