Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM43Q96BQ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM43Q96BQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms