Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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